河南农业大学学报

2013, v.47;No.180(06) 722-726+756

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稻瘟病病菌线粒体基因密码子使用偏好性分析
Analysis on codon usage preference of mitochondria genome of Magaporthe orisea

徐苏丽;王俊峰;陈士华;

摘要(Abstract):

利用Mobyle,DNAStar,SPSS等软件分析稻瘟病病菌线粒体13个基因密码子的使用模式和形成原因.结果显示,稻瘟病病菌线粒体基因组密码子GC含量较低、偏好性强,偏好使用A/T结尾的密码子,终止密码子偏好使用TAA.通过计算相对同义密码子使用度(RSCU)和密码子适应指数(CAI)确定了CCT,TGA等19个以A/T碱基结尾的最优密码子,并且它们的使用度随基因的表达水平升高而增加.中性绘图分析结果表明,密码子使用模式主要受选择作用的影响.

关键词(KeyWords): 稻瘟病;线粒体;密码子偏好性;最优密码子

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 河南省青年骨干教师资助项目(2010GGJS-086)

作者(Authors): 徐苏丽;王俊峰;陈士华;

DOI: 10.16445/j.cnki.1000-2340.2013.06.011

参考文献(References):

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