【目的】通过构建猪链球菌(Streptococcus suis,SS)2型(SS2)和9型(SS9)双重快速检测方法,为监测SS的流行和传播提供技术支持。【方法】分别以SS2特有荚膜多糖糖编码基因(capsular polysaccharide 2J gene, cps2J)和SS9特有荚膜多糖糖编码基因(capsular polysaccharide 9H gene, cps9H)为靶标设计引物和探针,对反应体系和反应条件进行优化,建立基础型重组酶聚合酶等温扩增(Basic-recombinase polymerase amplification, Basic-RPA)快速检测技术,并对其特异性、灵敏度、重复性和临床应用效果进行评价。【结果】构建的SS2/9双重Basic-RPA检测方法引物为CPS2J212和CPS9H304,引物体积V(CPS2J212/μL)∶V(CPS9H304/μL)为2.4∶1.8,反应温度为39℃,反应时间为20 min。特异性结果表明,该方法与其他常见病原体无交叉反应,特异性良好。灵敏度结果显示,该方法针对SS2/9检测限达到1×10-3 mg·L-1,优于常规PCR的1×10-2 mg·L-1。重复性结果显示,该方法有良好的稳定性。用该方法对41例临床样品进行检测,其检出率为24.4%,与单重Basic-RPA方法检测结果一致,高于细菌分离方法的检出率12.2%,以及常规PCR方法的检出率19.5%。【结论】构建的SS2/9的双重Basic-RPA检测方法,特异性和稳定性好,灵敏度高,可应用于SS快速诊断和血清分型。
综述了从机器学习到卷积神经网络(convolutional neural network, CNN)的作物病害识别融合改进方法,系统梳理了机器学习与CNN作物病害识别的关键技术,包括数据获取、数据处理、数据训练、网络架构选择、特征提取与融合、模型验证等6个应用流程,分析了两者性能差异的核心原因,归纳了二者共同面临的数据需求高、计算资源高和泛化能力不足的技术难点,对应总结了机器学习改进卷积神经网络作物病害识别关键技术的策略。最后,总结了当前研究存在的挑战,并展望了未来的研究方向。
【目的】实证分析数字乡村建设对产业振兴的效应,为促进乡村产业振兴提供理论支持和决策依据。【方法】基于2012—2022年中国30个省级(西藏及港澳台地区除外)面板数据,采用面板门槛回归模型和空间杜宾模型,构建数字乡村发展指数和乡村产业振兴指标体系,从农业结构合理化视角探究数字乡村建设对乡村产业振兴的影响机制。【结果】数字乡村建设能够显著提升乡村产业振兴,在经过稳健性检验后这一结论依然成立。门槛效应分析表明,农业结构合理化程度水平较低时,数字乡村对乡村产业振兴影响并不显著,随着地区农业结构合理化程度的提高并超过临界值时,会激发数字乡村建设的驱动效应,对乡村产业振兴具有正向促进作用,即呈现“U”型关系。空间效应分析表明,数字乡村建设能够产生正向的空间溢出效应,其在助力本地乡村产业振兴发展的同时,对周边地区的乡村产业振兴也具有促进作用。【结论】夯实农业转型基础,加大数字技术投入,建立跨地区数字乡村协同平台,增强数字市场空间溢出效应,制定差异化、动态化数字乡村发展政策,确保数字投入与地区农业结构精准匹配。
【目的】探究农村产业融合和农户家庭经济韧性的非线性关系。【方法】基于中国家庭追踪调查(China Family Panel Studies,CFPS)数据库2016—2020年数据,运用双重固定效应模型和门槛回归模型,实证检验农村产业融合对农户家庭经济韧性的影响,以及数字金融的门槛效应。【结果】农村产业融合对农户家庭经济韧性的影响呈先提升后降低的倒U型曲线,且影响强度具有个体异质性,对于新生代和低劳动技能农户,农村产业融合与农户家庭经济韧性的倒U型关系更显著,曲线较为陡峭。截至2020年,农村产业融合与农户家庭经济韧性的关系处于倒U型曲线拐点的左侧,农村产业融合有助于提升农户家庭经济韧性。农村产业融合对农户家庭经济韧性的影响具有非线性门槛效应,当数字金融达到一定门槛条件后,农村产业融合对农户家庭经济韧性具有正向影响。【结论】各级地方政府应加强引导合作社、企业等产业融合主体与小农户建立公平合理的利益分配机制,确保小农户能够充分享受产业融合带来的增值收益,同时,完善数字金融基础设施建设,发挥数字金融与农村产业融合的协同机制。
【目的】制备非结构蛋白1α(non-structural protein 1α, NSP1α)多克隆抗体,为深入研究NSP1α蛋白功能提供物质基础,并为猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproductive and respiratory syndrome, PRRS)防控靶点的选择提供新思路。【方法】以pCAGGS-NSP1α-HA质粒为模板,聚合酶链式反应扩增NSP1α基因,利用相关生物信息学在线软件分析PRRSV SD16毒株NSP1α基因和其他PRRSV毒株NSP1α基因序列同源性、蛋白的理化性质、氨基酸亲-疏水性、跨膜结构域、信号肽序列、磷酸化位点、二级和三级结构。通过EcoR I和Xho I酶切位点将NSP1α克隆至pET-28a-His原核表达载体。测序正确的pET-28a-NSP1α-His质粒转化至大肠杆菌E. coli BL21(DE3)表达感受态细胞,将诱导表达、纯化复性后的NSP1α蛋白免疫小鼠制备多克隆抗体,Western blot和间接免疫荧光试验(indirect immunofluorescence assay, IFA)鉴定制备的多克隆抗体的反应原性,通过Western blot和激光共聚焦分析NSP1α蛋白亚细胞分布。【结果】信息学分析结果表明,SD16毒株NSP1α蛋白有501个氨基酸,为不稳定的疏水性蛋白,其序列与HLJ毒株序列同源性最高,与I型PRRSV序列同源性最低;NSP1α蛋白无信号肽序列,无跨膜结构域,存在13个磷酸化位点;二级结构主要包含α-螺旋、延伸链和无规则卷曲。将获得的高纯度并且有活性的NSP1α蛋白进行小鼠免疫,检测其血清抗体效价可达1∶64 000。Western blot和IFA结果显示,制备的多克隆抗体特异性识别PRRSV NSP1α蛋白。Western blot和激光共聚焦结果显示,NSP1α蛋白主要定位在细胞核内。【结论】成功表达、纯化了PRRSV NSP1α蛋白并制备了鼠源多克隆抗体,该多克隆抗体与PRRSV NSP1α蛋白具有良好的反应活性和特异性。
通过分析扩展蛋白家族α-Expansin(EXPA)和β-Expansin(EXPB)的结构、蠕变特性,对其在植物生长发育和胁迫响应中的研究进展进行全面综述,探讨了EXPA与EXPB在种子萌发、籽粒发育、花粉管生长及胁迫响应中的关键作用。结合基因组学与蛋白质组学的最新成果,展望了扩展蛋白在作物抗逆性改良与产量提升中的应用潜力,以及其在作物改良和农业生产中的重要作用。
【目的】为解决园林废弃物处理过程中木质素降解困难的问题,从不同的园林废弃物堆肥中分离筛选木质素高效降解菌,并开发高效的木质素降解菌剂。【方法】利用梯度稀释法,以碱木质素为唯一碳源,从园林废弃物堆肥中筛选木质素降解菌,并利用苯胺蓝培养基筛选木质素高效降解菌;将高效降解菌株构建为3种微生物菌剂(细菌菌剂M01、真菌菌剂M02、细菌和真菌菌剂M03),利用分光光度法测定单菌株和3种菌剂的酶活力,验证菌剂产酶能力,并通过固态发酵试验验证3种菌剂的木质素降解效果。【结果】从园林废弃物堆肥中共筛选出了13株木质素高效降解菌,其中,6株为细菌,7株为真菌。利用以上菌株构建的3种菌剂产酶能力均强于单菌株,且菌剂M03的产酶能力最强,其产生的漆酶、木质素过氧化物酶和锰过氧化物酶的酶活力分别达到1 495.4、8 548.8和6 092.6 U·L-1。经固态发酵试验验证,与对照组及菌剂M01和M02处理组相比,菌剂M03处理组在实验室条件下对木质素的降解效果好,物料质量损失率达56.25%,木质素降解率达52.95%。【结论】菌剂M03是一种高效木质素降解菌剂,能够产生大量木质素降解酶,有效提高木质素降解效果。
【目的】从醋糟中筛选具有耐酸和耐胆盐特性,并能够抑制致病菌生长并具备抗氧化活性的乳酸菌菌株,为益生菌资源的开发及其在食品、饲料等领域的应用提供依据。【方法】采用平板划线法从醋糟中分离乳酸菌菌株,根据耐酸(pH值2.5)和耐胆盐(质量分数0.3%)特性,初步筛选后进行16S rRNA基因鉴定。评估菌株的抑菌活性并分析抑菌成分,测定其自聚集和共聚集能力。通过抗生素敏感性、溶血性和生物胺产生试验评估菌株安全性。采用1,1-二苯基-2-苦基肼(1,1-Diphenyl-2-picrylhydrazyl,DPPH)、2,2-联氮-二(3-乙基-苯并噻唑-6-磺酸)二铵盐(2,2′-azino-bis(3-ethylbenzothiazoline-6-sulfonic acid) diammonium salt,ABTS)、羟自由基和超氧阴离子清除法测定筛选菌株的抗氧化能力。【结果】从醋糟中分离得到36株具有溶钙圈的菌株,其中,19株为革兰氏阳性菌,经过耐酸和耐胆盐筛选,N3、N9和N16菌株表现出较强耐受性。经分子生物学鉴定,N3为乳酸片球菌(Pediococcus acidilactici),N9为植物乳杆菌(Lactiplantibacillus plantarum),N16为内氏液体乳杆菌(Liquorilactobacillus nagelii)。对这3株菌株的生物学特性和安全性评价发现,N16对万古霉素、利福平、头孢曲松、阿莫西林、氯霉素、环丙沙星和四环素均表现出耐药性,并能够利用精氨酸产生生物胺,对宿主健康构成潜在风险。N3、N9菌株对金黄色葡萄球菌(Staphyloccocus aureus)、鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella typhimurium)、大肠杆菌(Escherichia coli)表现出显著的抑菌效果,经验证起抑菌作用的主要为发酵液中的有机酸。此外,N3、N9菌株还表现出优异的自聚集、共聚集能力和疏水性,对氨苄西林、氯霉素、头孢曲松、庆大霉素、克林霉素、阿莫西林、利福平、四环素均敏感或中度敏感,没有溶血性,不产生对宿主有害的生物胺。在抗氧化能力方面,N3和N9菌株能有效清除DPPH自由基、ABTS自由基、羟自由基和超氧阴离子。【结论】N3和N9菌株具有优良的生物学特性、安全性及抗氧化能力,作为益生菌在动物饲料添加剂和人类膳食补充剂等方面具有较大应用潜力。
【目的】探究育苗和移栽方式组合处理对鲜烟叶和烤后烟叶理化性质的影响。【方法】以‘中烟100’为供试品种,对生态深栽、膜下小苗移栽2种移栽方式和湿润育苗、浅水育苗、干湿交替育苗、无纺布育苗和漂浮育苗5种育苗方式,采用双因素完全随机处理。系统分析育苗和移栽方式的组合处理,明确不同处理对鲜烟叶和烤后烟叶理化成分的影响。【结果】结果表明,对于鲜烟叶,移栽方式和育苗方式对多数指标存在交互作用。无纺布育苗和浅水育苗处理的β-胡萝卜素质量分数和单叶质量较高,生态深栽比膜下小苗处理增加了叶片单叶质量,生态深栽浅水育苗组合处理的鲜烟叶叶绿素a、叶绿素b、叶表面积、比叶质量、总糖、淀粉、还原糖和烟碱等指标数值较高,比膜下小苗漂浮育苗组合处理分别提升56.80%、39.74%、16.53%、11.03%、8.03%、8.19%、13.12%和3.98%。对于烤后烟叶,生态深栽浅水育苗和生态深栽无纺布育苗的处理可以提升烟叶的总糖、还原糖、总氮、烟碱和钾含量,其中生态深栽无纺布育苗处理较膜下小苗漂浮育苗的对照处理分别提高了10.34%、32.63%、1.19%、2.51%和16.38%。对烤后烟叶理化成分使用主成分分析降维,提取了3个主成分,累计贡献率为78.13%。其中,糖氮比、氮碱比、还原糖、总糖、糖碱比和烟碱对主成分影响较大,生态深栽浅水育苗和生态深栽无纺布育苗有更高的主成分得分值。【结论】综合方差分析和主成分分析,不同育苗和移栽方式的组合处理均对鲜烟叶和烤后烟叶理化成分产生影响,其中,生态深栽浅水育苗和生态深栽无纺布育苗组合处理显著提高了鲜烟叶和烤后烟叶的理化指标,改善了烤烟品质。
【目的】揭示玉米叶片衰老的特征特性及遗传基础,为优良种质资源的创制和新品种的选育提供理论支撑。【方法】在利用玉米单倍体育种技术进行资源创制的DH系中获得了一个叶片早衰的自交系,命名为ldhs1,对其展开表型的观察、生理生化指标的检测、组织学及细胞学的分析,利用正向遗传学和混合分组测序分析法(bulked-segregant analysis sequencing, BSA-seq)定位玉米叶片早衰相关基因。【结果】与正常持绿自交系L521相比,ldhs1在授粉后第10天开始出现自上而下的早衰,于叶缘出现黄化现象,并逐渐扩散至整个叶片,导致全叶变黄,叶片中的叶绿素含量下降,超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化物酶(POD)这2种关键的抗氧化酶活性也出现了明显的下降,同时丙二醛(MDA)出现过度积累,导致叶绿体发育不良,光合作用下降。通过构建杂交群体结合BSA-seq技术将玉米叶片早衰基因LDHS1定位于1号染色体的分子标记indel-12与indel-13之间,区间大小为1.06 Mb。【结论】创制的新型玉米自交系叶片自上而下早衰,通过对其ldhs1的特性分析和数量性状基因座(quantitative trait locus, QTL)定位,可以作为叶早衰分子机制研究的互补验证和补充。